多数人认为益生菌、益生元或益生质或者酵素彼此之间存在着一些关系。实际上，酵素与益生菌毫无关系，不过酵素有帮助人体食物消化的功能(分别分解淀粉、肉类以及蛋白质、胃酸)，因此，有一些人认为吃完酵素后排便变得相当顺畅。
购买的产品含有益生菌又有益生质的话，可以起到相辅相成作用。益生质则是属于短链的糖类，容易被细菌利用，供菌类生长，欧瀚文说，当购买的产品含有益生菌又有益生质的话，可以起到相辅相成作用。
益生菌在通过肠道时，可能会被胃酸或胆汁破坏(被破坏后所剩无几)，这时可以靠益生质搭救，可以快速得到能量并繁殖。就目前观念，益生菌宜多摄取多种种类，剂量则视个人体质作调整。
怕有小肠菌从过度生长问题，可改以低发酵糖类饮食(低FODMAP)。不过，医生警告，长期吃益生菌恐会导致小肠菌丛过度生长，再加上益生质，反让腹胀等肠胃道问题加剧，尤其对SIBO患者有很大危害。医生表示，怕有小肠菌从过度生长问题，可改以低发酵糖类饮食(低FODMAP)，维护肠胃道健康。
低FODMAP饮食：
水果类：橘子、香蕉、草莓、榴槤、葡萄、葡萄柚、甜瓜、猕猴桃、百香果、木瓜、八角茴香、橘柚。
蔬菜类：苜蓿、竹笋、豆苗、白菜、胡萝卜、芹菜、佛手、菜心、青豆、莴苣、橄榄、花生、南瓜、甜红椒、菠菜、西葫芦（黄）、甜花生、芋头、番茄、大头菜、地瓜、绿皮西葫芦。
谷物类：无麸质面包或其他谷物食物。大米、燕麦、玉米粥、小米、高粱、藜麦、树薯粉。
奶制品：无乳糖牛奶、燕麦奶、米浆、豆奶、硬质干酪、软质乳酪、无乳糖类酸奶。
